Vous êtes sur le point de vous lancer dans l’entrepreneuriat ou êtes déjà à la tête d’une start-up ? Vous vous posez la question du choix d’un expert-comptable pour votre start-up ? Découvrez notre sélection des meilleurs experts-comptables pour start-up, leurs avantages et nos conseils pour choisir le vôtre.
Voici les 6 meilleurs experts-comptables en ligne pour les start-ups en 2025 :
- LegalPlace Comptabilité – Le meilleur pour son expertise juridique
- Dougs – Le meilleur pour sa plateforme de gestion
- Keobiz – Le meilleur pour ses tarifs abordables
- L-Expert-Comptable.com – Le meilleur pour la transparence des prix
- Ça Compte Pour Moi – Le meilleur pour son excellent service client
- Indy – Le meilleur pour être autonome
Notre sélection d’experts-comptables pour start-up
LegalPlace Comptabilité
Plateforme de formalités et d’assistance juridiques en ligne, LegalPlace est encore un cabinet d’expertise comptable récent, mais qui gère déjà la comptabilité de nombreuses start-up.
- Création d'entreprise offerte
- Accompagnement dédié, illimité et gratuit
- Logiciel facile à utiliser
- Certaines prestations en option
Solution moderne et innovante, LegalPlace Comptabilité se distingue de ses concurrents grâce aux nombreux services juridiques annexes proposés par la legaltech LegalPlace. Vous bénéficiez ainsi d’un accompagnement à la fois comptable et juridique par un des experts du secteur. Votre comptable dédié suit l’intégralité de votre comptabilité, avec un accompagnement personnalisé et illimité, ainsi qu’un logiciel moderne et intuitif.
Les tarifs, avec un prix d’appel de 85€/mois pour les start-ups, sont modulables et uniquement sur devis. Vous pouvez opter pour un engagement annuel et ainsi profiter d’une réduction sur votre paiement. Tout est inclus, de l’accompagnement à l’établissement des comptes annuels. Seules les déclarations sont sur option. Pour en savoir plus, lire notre avis sur LegalPlace Comptabilité.
Dougs
Avec 37 000 entrepreneurs à son actif, l’expert-comptable Dougs propose un service 100% en ligne de gestion de la comptabilité et de la finance.
- Adapté à tous les statuts
- Logiciel et appli ergonomique et performant
- 100% conforme à la facturation électronique
- Certaines restrictions (volume de CA)
Dougs se démarque grâce à son logiciel complet, simple à utiliser et doté de nombreuses automatisations. Il permet aux dirigeants de start-up de gérer leur tenue comptable facilement avant qu’un expert Dougs prenne le relais. Avec Dougs, vous pouvez créer votre entreprise, gérer votre comptabilité, effectuer votre facturation en toute conformité (Facturation électronique), gérer vos notes de frais et IK. On retrouve même des services RH en option. Dougs se veut une solution globale pour accompagner les start-ups dans leur quotidien.
La formule à 79€/mois comprend la gestion de votre comptabilité de trésorerie, bilan et liasse fiscale inclus, et l’accompagnement personnalisé, gratuit et illimité par un comptable ou expert-comptable. Le logiciel de saisie, qui possède la fonction de synchronisation bancaire, est intuitif et performant et l’offre est sans engagement. Pour en savoir plus, lire notre avis sur Dougs.
Keobiz
Keobiz est un cabinet d’expertise comptable en ligne hybride qui accompagne plus de 17 000 indépendants et entrepreneurs dans la gestion quotidienne de leur entreprise.
- Création d'entreprise gratuite
- Conseiller spécialiste des start-ups
- Bilan et Liasse fiscale inclus dans toutes les formules
- Certaines options payantes
Membre du groupe Kerogo, Keobiz bénéficie d’un écosystème solide et d’une vision stratégique globale, fournissant un accompagnement efficace de ses clients dans leur croissance. Keobiz s’appuie sur un partenariat avec Pennylane pour proposer une solution complète et performante : comptabilité, facturation, trésorerie, achats, notes de frais, etc. Mais les services ne s’arrêtent pas là : création d’entreprise, paie, fiscalité, juridique, etc.
L’accompagnement est effectué par un conseiller spécialisé dans la comptabilité des start-ups et il est disponible par email et téléphone (il y a aussi un bureau à Paris et Rouen). Ses 4 formules à partir de 89€/mois, dont le prix évolue en fonction de votre CA, incluent la gestion comptable, de la saisie à l’édition des comptes annuels, l’accompagnement et l’accès aux outils de gestion. Appréciable pour ceux qui aiment les solutions tout-en-un ! Pour en savoir plus, lire notre avis sur Keobiz.
L-Expert-Comptable.com
Cabinet en ligne le plus ancien de notre sélection, L-Expert-Comptable.com a déjà accompagné plus de 50 000 consultants et prestataires de services, son coeur de cible.
- Création d'entreprise offerte
- Réalisation intégrale de vos déclarations fiscales
- Ligne directe de votre conseiller dédié
- Pas pour les micro-entreprises
De la création d’entreprise à la gestion de la comptabilité, L-Expert-Comptable.com offre une solution de gestion et pilotage globale, avec une offre dédiée aux start-ups. Depuis 2015, ils s’appuient sur Tiime comme partenaire de choix pour la facturation (et est donc conforme à la facturation électronique) et la création d’entreprise. Vous pouvez donc gérer votre comptabilité en ligne en toute autonomie et L-Expert-Comptable.com se charge de votre liasse fiscale et de vos déclarations.
Avec un tarif simple à partir de 79€/mois, sans engagement et tout compris, L-Expert-Comptable.com assure un accompagnement qualitatif, souvent relevé comme sa principale force par les start-ups qui choisissent de leur confier leur comptabilité. Pour en savoir plus, lire notre avis sur L-Expert-Comptable.com.
Ça Compte Pour Moi
Intégré au Groupe Compagnie Fiduciaire, Ça Compte Pour Moi est un expert-comptable en ligne créé en 2015. Solution universelle, il propose des offres sur-mesure pour répondre aux besoins de tous les secteurs d’activité, et notamment les start-ups.
- Formule moduable et personnalisée
- Avis clients excellents
- Partenariat avec Pennylane
- Quelques fonctionnalités uniquement disponibles sur option
Ses tarifs un peu plus élevés sont largement compensés par la qualité de son accompagnement. Les avis clients sont en effet excellents, et reflètent la simplicité d’utilisation de la plateforme collaborative et la réactivité du service. À l’instar de Keobiz, il s’appuie sur le logiciel Pennylane pour assurer la relation et la gestion comptable. Il traite aussi bien la comptabilité de trésorerie que la comptabilité d’engagement.
Les tarifs, à partir de 250€/mois pour une comptabilité d’engagement, sont personnalisés et modulables en fonction de votre chiffre d’affaires, et vos besoins grâce aux options complémentaires. L’offre est sans engagement. Il faudra donc passer par une demande de devis pour connaître le tarif de la formule la mieux adaptée. Pour en savoir plus, lire notre avis sur Ça Compte Pour Moi.
Indy
Indy n’est pas un cabinet d’expertise-comptable à proprement parler, mais les fonctionnalités de ce logiciel de comptabilité s’en rapprochent fortement, et vous pourrez l’utiliser seul ou en complément d’un comptable.
- Interface très simple et intuitive
- Compte bancaire pro gratuit
- Tarifs abordables
- Support uniquement par mail et par chat
- Quelques restrictions de statut et CA
Nous avons donc souhaité l’intégrer à notre sélection puisqu’Indy accompagne les start-ups dans l’intégralité de leur gestion comptable. De la tenue comptable à l’édition de la liasse fiscale et la télétransmission, l’ensemble est disponible sur une plateforme ergonomique, simple et intuitive. Indy propose un module de facturation gratuit et illimité. Et vous bénéficiez même d’un compte pro entièrement gratuit lui aussi.
À noter qu’Indy propose aussi la création de votre gratuitement pour ceux qui sont en train de se lancer. Avec deux offres tarifaires transparentes et abordables, vous pouvez tester l’outil gratuitement pendant 15 jours. Pour en savoir plus, lire notre avis sur Indy.
Il existe d’autres acteurs en ligne comme Amarris Direct, ainsi que de nombreux cabinets locaux, dont certains ont très bonne réputation auprès des start-ups. Vous pouvez aussi jeter un oeil du coté de Pennylane, déjà mentionné plus haut, un logiciel de comptabilité très complet et utilisé par de nombreux experts-comptables.
Tableau comparatif des meilleurs experts-comptables pour start-up
Pour vous aider à comparer les offres, voici un tableau récapitulant les principales caractéristiques des experts-comptables en ligne pour les start-ups.
| Tarifs (à partir de) | Essai gratuit | Application mobile | Facturation électronique | |
|---|---|---|---|---|
| LegalPlace Comptabilité | 39€ | 1 mois | ||
| Dougs | 79€ | 30 jours | ||
| Keobiz | 89€ | 1 mois | * | |
| L-Expert-Comptable.com | 79€ | 1 mois | * | |
| Ça Compte Pour Moi | 119€ | 3 mois | * | |
| Indy | 0€ | 15 jours |
Concernant les tarifs, il s’agit ici des prix d’appel mensuels communiqués par les marques. Selon les options et services souscrits, ces tarifs peuvent évoluer. En optant pour un engagement annuel, vous pouvez aussi faire baisser la facture.
Notez que tous les acteurs de notre sélection gèrent la comptabilité de trésorerie. En ce qui concerne la comptabilité d’engagement, Dougs, Keobiz et Ça Compte Pour Moi le proposent.
Autre point essentiel : ils incluent tous un module de facturation, soit en nom propre soit via un partenaire (Pennylane pour Ça Compte Pour Moi, L-Expert-Comptable.com et Keobiz), et sont tous conformes à la facturation électronique.
Enfin, ces formules incluent généralement l’accompagnement. Mais celui-ci peut varier selon les cabinets. Chez Dougs, vous pouvez contacter à tout moment votre comptable dédié via votre moyen de communication préféré. L’accompagnement est illimité avec LegalPlace Comptabilité. Avec Ça Compte Pour Moi, vous bénéficiez d’un rendez-vous téléphonique d’une heure avec un expert et vous êtes suivi par un juriste dédié.
Les avantages de prendre un expert-comptable pour votre start-up
Certains restaurateurs décident de gérer leur comptabilité eux-mêmes. C’est une pratique autorisée tant qu’ils respectent leurs obligations légales. D’autres font le choix judicieux de confier cette tâche fastidieuse et chronophage à un tiers. Et il y a plusieurs avantages à cela.
Tout d’abord, si vous lancez votre start-up, votre planning est certainement très chargé, avec de nombreuses prises de décision. Choisir de confier toute ou partie de votre comptabilité à un cabinet, c’est vous permettre de gagner du temps sur une tâche chronophage et bien souvent complexe. Vous pouvez ainsi vous concentrer sur votre coeur de métier et développer votre activité.
Un expert-comptable peut vous accompagner dès la phase de création, avec le choix du statut juridique de votre start-up par exemple mais aussi sur le financement, les aides et subventions, une levée de fonds, le dépôt de brevet, etc. Il aura l’expertise pour vous conseiller sur les meilleurs choix fiscaux, comptables et financiers. Expert de son domaine, il vous assure d’être conforme à vos obligations et de respecter les délais.
En effet, en comparant le temps que vous y passez et les honoraires d’un expert-comptable, vous vous apercevrez qu’il est souvent plus économique de confier une tâche que vous ne maîtrisez peu ou pas. Le risque d’erreurs (et les coûts que cela implique) est largement limité, vous gagnez du temps et vous pouvez être conseillé sur des optimisations fiscales.
De plus, si vous optez pour un expert-comptable en ligne pour start-up comme ceux de notre sélection, vos économies sont décuplées. Leurs tarifs sont jusqu’à 40% moins chers qu’un cabinet expert-comptable traditionnel, pour des prestations similaires. Et c’est aussi pour cela que nous les recommandons !
Comment choisir le meilleur expert-comptable pour votre start-up ?
Choisir un expert-comptable en ligne ne consiste pas à trouver le “meilleur” pour toutes les start-ups, mais celui qui correspond à votre type d’activité, votre profil et vos besoins. Chaque entrepreneur a des attentes différentes selon sa structure, son niveau d’autonomie et son budget. Pour une relation entre un expert-comptable et une start-up qui marche, cette dernière a tout intérêt à choisir un expert-comptable qui suit la même lignée qu’elle en termes d’innovation, de dynamisme et d’attrait pour le numérique par exemple.
La conformité et le type de comptabilité
Avant toute chose, assurez-vous que le cabinet est inscrit à l’Ordre des Experts-Comptables — gage de légalité et de sérieux.
Vérifiez ensuite le type de comptabilité proposé : comptabilité de trésorerie (enregistrement à la date des flux financiers) ou comptabilité d’engagement (enregistrement à la date des factures). Comme nous l’avons vu, tous les cabinets en ligne ne gèrent pas les deux types. Votre statut juridique (micro, SASU, SARL, etc.) et votre régime fiscal détermineront le mode le plus adapté.
Le secteur d’activité et la compatibilité
Certains cabinets refusent certains domaines d’activité, tandis que d’autres sont spécialisés par métier. Vérifiez que votre secteur d’activité est accepté et, idéalement, qu’une offre dédiée aux start-ups existe.
Les experts-comptables en ligne convainquent souvent les start-ups par leur réactivité, leur accessibilité 7j/7, leurs tarifs compétitifs et leurs outils modernes et intuitifs. Mais les cabinets d’expert-comptable physiques sont tout aussi compétents et offrent un accompagnement de proximité, à des tarifs un peu plus élevés.
L’accompagnement et les services associés
Les raisons premières qui vont motiver votre choix doivent aussi se porter sur la relation que vous entretenez avec votre expert-comptable. La qualité du conseil et l’expertise sur les spécificités des besoins des start-ups sont des éléments très importants.
Le niveau d’accompagnement varie selon les offres : comptable dédié, coach comptable ou support mutualisé. Certains cabinets incluent un conseil illimité, d’autres facturent les échanges supplémentaires ou les missions sociales (paie, contrats, fin de contrat).
Intéressez-vous aussi au canal de communication (chat, mail, téléphone, visioconférence) et à la réactivité de l’équipe. Vous pouvez vous appuyer sur les avis clients en ligne pour mieux évaluer la qualité de l’accompagnement client.
L’intégration et la technologie
L’intégration avec d’autres outils est aussi un critère de choix et montre la modernité du cabinet d’expertise-comptable. Un bon expert-comptable en ligne doit proposer une interface intuitive, reliée à votre banque pour start-up ou à votre logiciel de facturation par exemple. Cela permet de faire remonter en direct la plupart des dépenses, et surtout de les suivre, afin d’anticiper les besoins de trésorerie auxquels font face la plupart des start-ups.
Plus les intégrations sont fluides, plus la comptabilité est automatisée. C’est particulièrement essentiel si vous n’êtes pas à l’aise avec la comptabilité.
Le budget et la transparence
Comparez les formules d’abonnement, mais surtout le rapport qualité/prix : services inclus, options payantes, accompagnement, réputation du cabinet. N’hésitez pas à demander plusieurs devis en précisant votre chiffre d’affaires ou votre volume d’activité pour obtenir une estimation réaliste.
Bien évidemment, d’autres critères seront aussi à prendre en considération pour choisir un expert-comptable pour votre start-up : le type de prestation proposée (dont la création de la start-up), la durée d’engagement, les conditions de résiliation, les tarifs et les frais cachés.
Quel est le tarif d’un expert-comptable pour start-up ?
Le prix d’un expert-comptable en ligne pour start-up repose sur l’un ou plusieurs de ces éléments :
- la forme juridique de votre entreprise ;
- le secteur d’activité ;
- le type de missions réalisées ;
- le volume de chiffre d’affaires/mouvements comptables ;
- le nombre de salariés ;
- le niveau d’accompagnement ;
- les services annexes.
D’une manière générale, le tarif d’un expert-comptable en ligne est moins cher qu’un expert-comptable traditionnel puisque le premier peut notamment économiser sur les frais de fonctionnement.
Pour trouver le bon expert-comptable, nous conseillons toujours de faire plusieurs demandes de devis et d’analyser précisément ce qui est inclus ou non, les évolutions tarifaires, etc. En effet, avec tous ces facteurs à intégrer, il est difficile de donner des tarifs précis. Une start-up est également vouée à grandir rapidement. Soyez précis dans l’évaluation de besoins actuels mais aussi futurs, pour éviter les mauvaises surprises. Cela vous évitera d’avoir à changer d’expert-comptable.
Vous trouverez dans notre tableau comparatif ci-dessus les prix d’appels des acteurs de notre sélection.
Sachez aussi que la plupart de ces acteurs proposent des essais gratuits : profitez d’1 mois gratuit avec Keobiz et de 30 jours gratuits avec Dougs. C’est un bon moyen de tester l’offre avant de vous engager.
Expert-comptable pour start-up : est-ce obligatoire ?
Commençons par la théorie : quel que soit son statut juridique ou son régime d’imposition, une start-up n’a aucune obligation à faire appel à un expert-comptable pour gérer la comptabilité. Il est tout à fait possible la réaliser entièrement en interne ou de confier seulement une partie à un expert-comptable.
Mais dans la pratique, les obligations comptables qui relèvent de votre statut juridique peuvent vous pousser à confier cette mission à un professionnel. Certaines tâches comptables peuvent se révéler très exigeantes et l’accompagnement d’un expert-comptable est souvent fortement conseillé.
En tant que start-up, vous êtes en effet soumis à un certain nombre d’obligations comptables. Elles dépendent de votre statut juridique.
Il existe donc de nombreuses situations possibles, mais nous pouvons les regrouper en trois catégories :
- vous êtes sous le régime micro (auto-entrepreneur, TPE sous conditions) : la comptabilité est ultra-simplifiée et consiste en un journal des dépenses et des recettes et un registre des achats ;
- vous êtes soumis au régime réel simplifié (entreprises commerciales sous conditions) : vous devez tenir une comptabilité (de trésorerie) simplifiée en éditant et déposant les comptes annuels dans leur version simplifiée ;
- vous êtes soumis au régime réel normal : la comptabilité est plus complexe et induit de tenir une comptabilité d’engagement, avec de nombreuses annexes (inventaire, etc.), de déposer ses comptes annuels et de réaliser les déclarations fiscales.
La première étape est donc de définir vos obligations comptables, puis vous pourrez faire votre choix entre deux options :
- gérer seul votre comptabilité grâce à un logiciel de comptabilité ;
- vous faire accompagner par un expert-comptable (physique ou en ligne).
Au-delà des obligations légales, rappelons aussi que la comptabilité est un réel outil de pilotage financier pour le dirigeant de start-up.
FAQ
Le comptable est-il obligatoire pour une startup ?
Non, un comptable ou un expert-comptable n’est jamais obligatoire. Ce qui l’est, c’est de tenir une comptabilité correcte, et compte tenu de la complexité de la comptabilité des start-up, prendre un expert-comptable est fortement recommandé.
Quelles sont les spécificités de la comptabilité des start-ups ?
Il n’y a pas de règle commune à la comptabilité de toutes les start-up, puisque les obligations comptables dépendent du statut juridique choisi. Mais ce qui revient le plus souvent parmi les besoins concerne la quantité de flux (notamment paiements en ligne…) et les besoins en financement, pour lesquels un expert-comptable semble nécessaire.
Combien coûte un expert-comptable pour start-up ?
Les experts-comptables peuvent fixer librement leurs honoraires. Les critères utilisés sont généralement : le type de prestations, le volume de CA, le volume de mouvements comptables à traiter, le secteur d’activité, le nombre de salariés, la renommée ou la localisation du cabinet comptable.
- Entreprises : connaître vos obligations comptables — BPI France
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Guillaume est le cofondateur d'independant.io. Diplômé d'HEC en marketing digital, il a passé 7 ans chez Google en tant qu'analyste dans les équipes dédiées aux clients du secteur de la finance.