La gestion financière est cruciale, mais choisir le bon expert-comptable en ligne est un défi pour les TPE et PME. L’optimisation des coûts et la simplicité sont primordiales. Pour simplifier votre comptabilité et développer votre activité, découvrez notre sélection des meilleurs experts-comptables en ligne pour TPE-PME, leurs avantages et nos conseils pour choisir le vôtre.
Voici les 5 meilleurs experts-comptables en ligne pour les TPE-PME en 2025 :
- Dougs – Le meilleur pour sa plateforme de gestion
- Keobiz – Le meilleur pour ses tarifs abordables
- LegalPlace Comptabilité – Le meilleur pour son expertise juridique
- L-Expert-Comptable.com – Le meilleur pour les TPE/PME prestataires de services
- Ça Compte Pour Moi – Le meilleur pour son excellent service client
Notre sélection des meilleurs experts-comptables en ligne pour TPE et PME
Dougs
Avec 37 000 entrepreneurs à son actif, l’expert-comptable Dougs propose un service 100% en ligne de gestion de la comptabilité et de la finance.
- Adapté à tous les statuts
- Logiciel et appli ergonomique et performant
- 100% conforme à la facturation électronique
- Certaines restrictions (volume de CA)
Dougs se démarque grâce à son logiciel complet, simple à utiliser et doté de nombreuses automatisations. Il permet aux dirigeants de TPE-PME de gérer leur tenue comptable facilement avant qu’un expert Dougs prenne le relais. Avec Dougs, vous pouvez créer votre entreprise, gérer votre comptabilité, effectuer votre facturation en toute conformité (Facturation électronique), gérer vos notes de frais et IK. On retrouve même des services RH en option. Dougs se veut une solution globale pour accompagner les entreprises dans leur quotidien.
La formule à 79€/mois comprend la gestion de votre comptabilité de trésorerie, bilan et liasse fiscale inclus, et l’accompagnement personnalisé, gratuit et illimité par un comptable ou expert-comptable. Le logiciel de saisie, qui possède la fonction de synchronisation bancaire, est intuitif et performant et l’offre est sans engagement. Pour en savoir plus, lire notre avis sur Dougs.
Keobiz
Keobiz est un cabinet d’expertise comptable en ligne hybride qui accompagne plus de 17 000 indépendants et entrepreneurs dans la gestion quotidienne de leur entreprise.
- Création d'entreprise gratuite
- Conseiller spécialiste des TPE-PME
- Bilan et Liasse fiscale inclus dans toutes les formules
- Certaines options payantes
Membre du groupe Kerogo, Keobiz bénéficie d’un écosystème solide et d’une vision stratégique globale, fournissant un accompagnement efficace de ses clients dans leur croissance. Keobiz s’appuie sur un partenariat avec Pennylane pour proposer une solution complète et performante : comptabilité, facturation, trésorerie, achats, notes de frais, etc. Mais les services ne s’arrêtent pas là : création d’entreprise, paie, fiscalité, juridique, etc.
L’accompagnement est effectué par un conseiller spécialisé dans la comptabilité des TPE-PME et il est disponible par email et téléphone (il y a aussi un bureau à Paris et Rouen). Ses 4 formules à partir de 89€/mois, dont le prix évolue en fonction de votre CA, incluent la gestion comptable, de la saisie à l’édition des comptes annuels, l’accompagnement et l’accès aux outils de gestion. Appréciable pour ceux qui aiment les solutions tout-en-un ! Pour en savoir plus, lire notre avis sur Keobiz.
LegalPlace Comptabilité
Plateforme de formalités et d’assistance juridiques en ligne, LegalPlace est encore un cabinet d’expertise comptable récent, mais qui gère déjà la comptabilité de nombreuses TPE et PME.
- Création d'entreprise offerte
- Accompagnement dédié, illimité et gratuit
- Logiciel facile à utiliser
- Certaines prestations en option
Solution moderne et innovante, LegalPlace Comptabilité se distingue de ses concurrents grâce aux nombreux services juridiques annexes proposés par la legaltech LegalPlace. Vous bénéficiez ainsi d’un accompagnement à la fois comptable et juridique par un des experts du secteur. Votre comptable dédié suit l’intégralité de votre comptabilité, avec un accompagnement personnalisé et illimité, ainsi qu’un logiciel moderne et intuitif.
Les tarifs, avec un prix d’appel de 85€/mois pour les TPE et PME, sont modulables et uniquement sur devis. Vous pouvez opter pour un engagement annuel et ainsi profiter d’une réduction sur votre paiement. Tout est inclus, de l’accompagnement à l’établissement des comptes annuels. Seules les déclarations sont sur option. Pour en savoir plus, lire notre avis sur LegalPlace Comptabilité.
L-Expert-Comptable.com
Cabinet en ligne le plus ancien de notre sélection, L-Expert-Comptable.com a déjà accompagné plus de 50 000 consultants et prestataires de services, son coeur de cible.
- Création d'entreprise offerte
- Réalisation intégrale de vos déclarations fiscales
- Ligne directe de votre conseiller dédié
- UNIQUEMENT pour les consultants et entreprises de prestation de service
De la création d’entreprise à la gestion de la comptabilité, L-Expert-Comptable.com offre une solution de gestion et pilotage globale, avec une offre dédiée aux start-ups. Depuis 2015, ils s’appuient sur Tiime comme partenaire de choix pour la facturation (et est donc conforme à la facturation électronique) et la création d’entreprise. Vous pouvez donc gérer votre comptabilité en ligne en toute autonomie et L-Expert-Comptable.com se charge de votre liasse fiscale et de vos déclarations.
Avec un tarif simple à partir de 79€/mois, sans engagement et tout compris, L-Expert-Comptable.com assure un accompagnement qualitatif, souvent relevé comme sa principale force par les TPE-PME qui choisissent de leur confier leur comptabilité. Pour en savoir plus, lire notre avis sur L-Expert-Comptable.com.
Ça Compte Pour Moi
Intégré au Groupe Compagnie Fiduciaire, Ça Compte Pour Moi est un expert-comptable en ligne créé en 2015. Solution universelle, il propose des offres sur-mesure pour répondre aux besoins de tous les secteurs d’activité des TPE et PME.
- Formule moduable et personnalisée
- Avis clients excellents
- Partenariat avec Pennylane
- Quelques fonctionnalités uniquement disponibles sur option
Ses tarifs un peu plus élevés sont largement compensés par la qualité de son accompagnement. Les avis clients sont en effet excellents, et reflètent la simplicité d’utilisation de la plateforme collaborative et la réactivité du service. À l’instar de Keobiz, il s’appuie sur le logiciel Pennylane pour assurer la relation et la gestion comptable. Il traite aussi bien la comptabilité de trésorerie que la comptabilité d’engagement.
Les tarifs, à partir de 250€/mois pour une comptabilité d’engagement, sont personnalisés et modulables en fonction de votre chiffre d’affaires, et vos besoins grâce aux options complémentaires. L’offre est sans engagement. Il faudra donc passer par une demande de devis pour connaître le tarif de la formule la mieux adaptée. Pour en savoir plus, lire notre avis sur Ça Compte Pour Moi.
Précurseur de l’expertise-comptable en ligne, Amarris Direct proposait jusqu’à peu des services de comptabilité parfaitement adaptés aux TPE et PME, mais s’est depuis réorienté sur une offre qui s’adresse aujourd’hui à une catégorie plus limitée d’entreprises et d’indépendants : les professions libérales, les professions médicales, et les prestataires de services.
Tableau comparatif des meilleurs experts-comptables pour TPE-PME
Pour vous aider à comparer les offres, voici un tableau récapitulant les principales caractéristiques des experts-comptables en ligne pour les TPE-PME.
| Tarifs (à partir de) | Essai gratuit | Application mobile | Facturation électronique | |
|---|---|---|---|---|
| Dougs | 79€ | 30 jours | ||
| Keobiz | 89€ | 1 mois | * | |
| LegalPlace Comptabilité | 39€ | 1 mois | ||
| L-Expert-Comptable.com | 79€ | 1 mois | * | |
| Ça Compte Pour Moi | 119€ | 3 mois | * |
Notez que tous les acteurs de notre sélection gèrent la comptabilité de trésorerie. En ce qui concerne la comptabilité d’engagement, Dougs, Keobiz et Ça Compte Pour Moi le proposent.
Concernant les tarifs, il s’agit ici des prix d’appel mensuels communiqués par les marques. Selon les options et services souscrits, ces tarifs peuvent évoluer. En optant pour un engagement annuel, vous pouvez aussi faire baisser la facture.
Autre point essentiel : ils incluent tous un module de facturation, soit en nom propre soit via un partenaire (Pennylane pour Ça Compte Pour Moi, L-Expert-Comptable.com et Keobiz), et sont tous conformes à la facturation électronique.
Enfin, ces formules incluent généralement l’accompagnement. Mais celui-ci peut varier selon les cabinets. Chez Dougs, vous pouvez contacter à tout moment votre comptable dédié via votre moyen de communication préféré. L’accompagnement est illimité avec LegalPlace Comptabilité. Avec Ça Compte Pour Moi, vous bénéficiez d’un rendez-vous téléphonique d’une heure avec un expert et vous êtes suivi par un juriste dédié.
Les avantages de prendre un expert-comptable pour votre TPE ou PME
Recourir à un expert-comptable pour la gestion de votre TPE-PME n’est pas obligatoire, quel que soit le statut, tant que vous respectez les obligations légales. Certains décident donc de gérer leur comptabilité seul, en interne. D’autres font le choix judicieux de confier cette tâche fastidieuse et chronophage à un tiers. Et il y a plusieurs avantages à cela.
Le premier avantage est la sécurisation de l’activité. La fiscalité, le droit social et les normes comptables sont des domaines complexes et en perpétuelle évolution. En déléguant ces tâches, le dirigeant de TPE ou PME s’assure d’être en parfaite conformité avec la loi, évitant ainsi les redressements fiscaux, les pénalités de retard ou les erreurs de paie. C’est la garantie d’une tranquillité d’esprit inestimable.
Ensuite, l’expert-comptable permet un gain de temps considérable. La gestion administrative est chronophage et souvent sans valeur ajoutée directe pour le business. En se déchargeant de la saisie et des déclarations, l’entrepreneur peut se recentrer sur son cœur de métier : la vente, la production et le développement commercial.
Un autre atout est sans conteste l’optimisation économique.
Recruter un comptable en interne représente un coût fixe lourd pour une petite structure (salaires, charges patronales, congés, licences de logiciels), souvent disproportionné par rapport au volume réel de travail. En externalisant, vous transformez ces charges fixes en coûts variables : vous ne payez que pour la prestation nécessaire, réalisant ainsi une économie substantielle qui peut être réinvestie ailleurs. De plus, si vous optez pour un expert-comptable en ligne comme ceux de notre sélection, vos économies sont décuplées.
Enfin, au-delà des chiffres, l’expert-comptable joue un rôle de conseiller privilégié. Grâce à des outils de pilotage (tableaux de bord, prévisionnels de trésorerie), il aide à prendre les bonnes décisions d’investissement ou d’embauche. Sa signature apporte également une crédibilité indispensable auprès des banques lors des demandes de financement.
En résumé, s’entourer d’un expert-comptable, c’est transformer une obligation administrative en un véritable atout compétitif.
Comment choisir l’expert-comptable de votre TPE-PME ?
Choisir un expert-comptable en ligne ne consiste pas à trouver le “meilleur” pour toutes les TPE-PME, mais celui qui correspond à votre type d’activité, votre profil et vos besoins. Chaque entrepreneur a des attentes différentes selon sa structure, son niveau d’autonomie et son budget.
La conformité et le type de comptabilité
Avant toute chose, assurez-vous que le cabinet est inscrit à l’Ordre des Experts-Comptables — gage de légalité et de sérieux.
Vérifiez ensuite le type de comptabilité proposé : comptabilité de trésorerie (enregistrement à la date des flux financiers) ou comptabilité d’engagement (enregistrement à la date des factures). Comme nous l’avons vu, tous les cabinets en ligne ne gèrent pas les deux types. Votre statut juridique (SAS, SARL, etc.) et votre régime fiscal détermineront le mode le plus adapté.
Le secteur d’activité et la compatibilité
Certains cabinets refusent certains domaines d’activité, tandis que d’autres sont spécialisés par métier. Vérifiez que votre secteur d’activité est accepté et, idéalement, qu’une offre dédiée aux TPE-PME existe. Le cabinet d’expertise-comptable doit être capable de vous accompagner et vous conseiller sur les meilleures options comptables et fiscales pour votre situation : quel statut ? quel régime ? comptabilité de trésorerie ou d’engagement ? etc.
De même, certaines entreprises avec un chiffre d’affaires élevé ou des besoins complexes devront plutôt se tourner vers des cabinets plus traditionnels ou hybrides.
L’accompagnement et les services associés
Les raisons premières qui vont motiver votre choix doivent aussi se porter sur la relation que vous entretenez avec votre expert-comptable. La qualité du conseil et l’expertise sur les spécificités des besoins des TPE-PME sont des éléments très importants.
Le niveau d’accompagnement varie selon les offres : comptable dédié, coach comptable ou support mutualisé. Certains cabinets incluent un conseil illimité, d’autres facturent les échanges supplémentaires ou les missions sociales (paie, contrats, fin de contrat). Intéressez-vous aussi au canal de communication (chat, mail, téléphone, visioconférence) et à la réactivité de l’équipe.
Concernant les services, pouvoir déléguer certaines tâches nous semblent indispensables pour les TPE-PME. On pense notamment à la gestion sociale pour vos salariés : rédaction des contrats, étalissement des fiches de paie, déclarations sociales, etc.
Un module de facturation peut être intéressant pour les entreprises qui doivent éditer des factures. Mais surtout, celui-ci doit être conforme à la facturation électronique pour vous éviter d’avoir à en changer bientôt. Comme nous l’avons vu, certains experts-comptables en ligne ont créé leur propre solution, comme LegalPlace Comptabilité, alors que d’autres s’appuient sur un partenaire.
D’autres services peuvent également être utiles : un compte pro (comme chez L-Expert-Comptable.com), la gestion des notes de frais (Keobiz) ou encore la réalisation de formalités juridiques (chez LegalPlace Comptabilité).
L’intégration et la technologie
L’intégration avec d’autres outils est aussi un critère de choix et montre la modernité du cabinet d’expertise-comptable. Un bon expert-comptable en ligne doit proposer une interface intuitive, reliée à votre banque pour PME, votre logiciel de caisse ou votre logiciel de facturation par exemple. Cela permet de faire remonter en direct la plupart des dépenses, et surtout de les suivre, afin d’anticiper les besoins de trésorerie auxquels font face la plupart des TPE-PME.
Plus les intégrations sont fluides, plus la comptabilité est automatisée. C’est particulièrement essentiel si vous n’êtes pas à l’aise avec la comptabilité.
Idéalement, le logiciel doit inclure des modules de pilotage de votre activité. Il doit vous pemettre d’analyser vos marges, de suivre votre trésorerie et d’établir des prévisions financières. Il devient un outil indispensable au quotidien.
Le budget et la transparence
Comparez les formules d’abonnement, mais surtout le rapport qualité/prix : services inclus, options payantes, accompagnement, réputation du cabinet. N’hésitez pas à demander plusieurs devis en précisant votre chiffre d’affaires ou votre volume d’activité pour obtenir une estimation réaliste.
Quel est le tarif d’un expert-comptable pour TPE ou PME ?
Le prix d’un expert-comptable en ligne que ce soit pour une TPE ou une PME repose sur l’un ou plusieurs de ces éléments :
- la forme juridique de votre entreprise ;
- le secteur d’activité ;
- le type de missions réalisées ;
- le volume de chiffre d’affaires/mouvements comptables ;
- le nombre de salariés ;
- le niveau d’accompagnement ;
- les services annexes.
D’une manière générale, le tarif d’un expert-comptable en ligne est moins cher qu’un expert-comptable traditionnel puisque le premier peut notamment économiser sur les frais de fonctionnement.
Cependant, face à la diversité des situations, il n’existe pas de prix universel. Pour choisir la meilleure offre, la règle d’or est la comparaison. Multipliez les demandes de devis et décortiquez la lettre de mission avant de signer : c’est ce contrat qui définit précisément ce qui est inclus dans le forfait et ce qui sera facturé en supplément.
Vous trouverez dans notre tableau comparatif ci-dessus les prix d’appels des acteurs de notre sélection.
Sachez aussi que la plupart de ces acteurs proposent des essais gratuits : profitez d’1 mois gratuit avec Keobiz et de 30 jours gratuits avec Dougs. C’est un bon moyen de tester l’offre avant de vous engager.
Expert-comptable pour TPE-PME : est-ce obligatoire ?
Commençons par la théorie : comme nous l’avons dit, quel que soit son statut juridique ou son régime d’imposition, une TPE ou une PME n’a aucune obligation à faire appel à un expert-comptable pour gérer la comptabilité. Il est tout à fait possible de la réaliser entièrement en interne ou de confier seulement une partie à un expert-comptable.
Mais dans la pratique, les obligations comptables qui relèvent de votre statut juridique peuvent vous pousser à confier cette mission à un professionnel. Certaines tâches comptables peuvent se révéler très exigeantes et l’accompagnement d’un expert-comptable est souvent fortement conseillé.
Les obligations comptables de votre TPE-PME dépendent du statut juridique et fiscal que vous aurez choisi et de la taille de l’entreprise.
Pour faire simple, en tant que gérant d’une TPE-PME, vous serez soumis à l’un des trois régimes suivants :
- le régime réel normal et la comptabilité classique : tenir une comptabilité d’engagement, réaliser un inventaire, établir et déposer les comptes annuels ;
- le régime réel simplifié et la comptabilité simplifiée : tenir une comptabilité de trésorerie et une présentation simplifiée des comptes annuels ;
- le régime micro et la comptabilité ultra-simplifiée : tenir un journal des dépenses et des recettes, un registre des achats dans certains cas et conserver les pièces justificatives.
Il existe donc des situations variées en fonction de votre statut juridique et de votre régime fiscal. La comptabilité d’une entreprise n’est ainsi pas la même pour toutes les TPE et PME. Le régime micro reste relativement simple à appréhender, mais il est peu adapté au TPE-PME. C’est moins vrai pour les autres régimes, pour lesquels la comptabilité est plus complexe, avec des obligations exigeantes et des conséquences lourdes en cas d’erreur.
La première étape est donc de définir vos obligations comptables, puis vous pourrez faire votre choix entre deux options :
- faire seul (à l’aide d’un logiciel de comptabilité pour TPE ou PME) ;
- vous faire accompagner par un expert-comptable (physique ou en ligne).
FAQ
Un comptable est-il obligatoire pour les TPE ?
Faire appel à un expert-comptable n’est pas obligatoire pour une TPE-PME. Vous êtes légalement autorisé à tenir votre comptabilité seul ou en interne, tant que les obligations comptables sont respectées. Au vu de la complexité de certaines gestions comptables, prendre un expert-comptable est tout de même fortement recommandé.
Cabinet d’expertise-comptable ou expert-comptable en ligne pour une TPE/PME ?
Ça dépend ! Si vous souhaitez un accompagnement de proximité ou si vos besoins sont complexes, un cabinet physique peut être plus adapté. Si vos besoins sont standards, que vous avez un petit budget et un enclin pour les solutions digitales et automatisées, alors l’expert-comptable en ligne est une bonne solution.
Quel est le prix d’un comptable pour une petite entreprise ?
Le prix d’un comptable pour une TPE ou PME est très variable et repose sur de nombreux critères comme nous l’avons mentionné ci-dessus. Une fois vos besoins définis, nous vous conseillons de faire plusieurs demandes de devis pour comparer les tarifs pratiqués.
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Clémence est diplômée de l'Institut d'Administration des Entreprises, avec un master dans les ressources humaines. Après plusieurs années à travailler dans les RH, puis le marketing en ligne et la rédaction web, elle a rejoint independant.io en 2022 en tant que responsable des contenus sur plusieurs catégories. Côté loisirs, Clémence est passionnée de running et d'équitation.




