Les 11 meilleurs logiciels de facturation pour auto-entrepreneur en 2025

Comme toutes les tâches administratives, la facturation est souvent redoutée par les auto-entrepreneurs. Et pourtant, elle est plus qu’essentielle pour le bon fonctionnement de l’entreprise. Alors pour vous simplifier la vie dans l’accomplissement de cette mission (parfois ingrate), il existe des logiciels de facturation pour auto-entrepreneur.

Pour vous aider à faire le bon choix, nous avons donc sélectionné plusieurs logiciels qui correspondent à la très grande majorité des besoins :

• Abby – Tous métiers
• Obat – Artisans
• Indy – Professions libérales
• Evoliz – Tous métiers
• Sage 50 – Tous métiers
• Axonaut – Tous métiers
• INFast – Tous métiers
• MaCompta – Tous métiers
• Tolteck – Artisans
• Tiime – Tous métiers
• Freebe – Freelances

Vous remarquerez que notre sélection contient uniquement des logiciels dits SaaS, utilisables directement en ligne. Plus modernes, avec un rapport qualité/prix plus intéressant et adaptés aux professionnels en mouvement, ils conviennent davantage à votre statut selon nous. Nous avons donc concentré notre sélection sur ce type de logiciel pour auto-entrepreneur.

Notre sélection des meilleurs logiciels de facturation pour auto-entrepreneur

1. Abby

Plus récemment arrivé sur le marché des logiciels de facturation pour les auto-entrepreneurs, Abby a de nombreux arguments pour plaire.

La création d’un compte est 100% gratuite sans limite de durée, et permet déjà de gérer la facturation et la comptabilité d’une micro-entreprise (devis et facturation, synchronisation bancaire, gestion des tâches , déclarations URSSAF…).

Abby est donc un logiciel de gestion tout-en-un pour les auto-entrepreneurs. Il rassemble toutes les fonctionnalités nécessaires à la gestion administrative et au pilotage de votre activité. De la facturation aux déclarations obligatoires en passant par la gestion de votre portefeuille de clients, rien n’est oublié.

2. Obat

Lui aussi destiné aux artisans et professionnels du bâtiment, Obat est un logiciel de facturation qui fait gagner du temps.

L’édition d’un devis ou d’une facture se fait en quelques clics. Les fonctions spécifiques à ce secteur d’activité n’ont pas été oubliées comme la création des factures d’acompte ou de situation de travaux ou l’utilisation de diverses bibliothèques d’ouvrages. Obat inclut également un tableau de bord pour piloter votre activité et vous aide dans la préparation de votre comptabilité.

Avec une grille tarifaire simple et transparente, un accompagnement réactif et une prise en main facile, Obat est l’un des meilleurs logiciels de facturation en ligne pour artisans.

3. Indy

Indy est un logiciel de comptabilité moderne et intuitif, au tarif fixe et transparent. Il s’adresse aux professions libérales qui souhaitent prendre en main leur gestion comptable. La partie facturation est disponible dans un module 100% gratuit.

Avec deux offres tarifaires transparentes et abordables, le logiciel de comptabilité en ligne Indy offre l’accès à de nombreuses fonctionnalités parfaitement adaptées aux besoins des activités libérales.

De la tenue comptable à l’édition de la liasse fiscale et la télétransmission, tout est disponible sur une plateforme ergonomique, simple et intuitive. Seul bémol, il faudra vous équiper d’un autre outil pour la facturation puisqu’Indy ne dispose pas de module de facturation pour le moment. À noter qu’Indy propose la création d’entreprise gratuitement pour ceux qui sont en train de se lancer.

4. Evoliz

Evoliz est avant tout un logiciel de devis et factures pour les auto-entrepreneurs. Mais ses nombreuses fonctionnalités en font également un outil de gestion et de comptabilité plus complet, à un tarif abordable.

De nombreux processus sont automatisés et font gagner pas mal de temps et permettent de suivre vos ventes, les délais de paiement client ou encore vos factures impayées.

Le logiciel est simple à utiliser, et est adapté à de nombreux métiers, dont les artisans et commerçants. Pour ne rien gâcher Evoliz est 100% Français, et est adapté aux sociétés si vous devez ou souhaitez un jour créez une société.

5. Sage 50

Logiciel de gestion très complet, Sage 50 est un outil de facturation adapté pour les auto-entrepreneurs.

La formule Gestion de Sage 50 vous permet de gérer votre facturation. Édition de devis et factures, gestion des contacts, création d’un catalogue, paiement en ligne, gestion des achats et des stocks : les fonctionnalités sont avancées, notamment si vous montez en gamme. L’interface est simple à prendre en main et de nombreuses ressources sur l’utilisation sont mises à disposition.

On apprécie aussi la tarification transparente et l’essai gratuit de 30 jours.

6. Axonaut

Solution tout-en-un très complète, Axonaut est un logiciel de facturation mais aussi de CRM, comptabilité et trésorerie.

Enrichie de votre base client et votre catalogue, l’interface épurée d’Axonaut vous permet ainsi de créer devis, factures et bons de commande en quelques clics. Il est bien évidemment conforme à la future législation puisqu’il permet de créer des factures Factur-X. Vous pouvez aussi proposer le paiement en ligne (par CB ou prélèvement) à vos clients. Plus qu’un logiciel de facturation, Axonaut regroupe de nombreuses autres fonctionnalités pour la comptabilité, la trésorerie et le CRM. Toutes vos données sont centralisées et synchronisées pour vous faire gagner un temps considérable sur votre gestion.

Avec Axonaut, vous accédez à l’ensemble des fonctionnalités au tarif unique de base à partir de 41,99€/mois pour un utilisateur (tarif variable selon la durée d’engagement, utilisateurs additionnels en option). Pour en savoir plus, lire notre avis sur Axonaut.

7. INFast

INFast est un logiciel de facturation 100% en ligne et adapté aux micro-entreprises.

Simple à utiliser, INFast va à l’essentiel et vous permet d’éditer vos devis, factures, factures d’acompte et factures de situation. Accessible hors ligne, vous pouvez créer vos documents chez vos clients ou en déplacement. Le répertoire client vous permet de suivre et relancer vos clients pour la signature ou le paiement de vos factures. Vos clients peuvent quant à eux payer leurs factures en ligne grâce au partenariat avec Mangopay.

L’offre est complète, le service client est réactif et l’essai gratuit donne toutes les raisons de tester l’outil.

8. Tolteck

Pratique et facile à utiliser, Tolteck est un logiciel de facturation dédié aux artisans du bâtiment, auto-entrepreneurs ou non.

Tolteck regroupe toutes les fonctionnalités nécessaires à la facturation de vos prestations. On trouve notamment une bibliothèque d’ouvrages et de matériaux pour créer rapidement vos devis et factures, un mode hors ligne pour accéder à l’outil depuis vos chantiers ou encore un fichier client pour gérer votre relation clients de façon plus fluide.

D’un rapport qualité/prix indéniable, on regrette simplement l’absence d’une connexion bancaire. Malgré tout, l’outil fait incontestablement gagner beaucoup de temps, et ce dès la première utilisation. L’offre tarifaire est simple et inclut un essai gratuit d’un mois.

9. MaCompta.fr

Le logiciel en ligne Macompta.fr propose une offre complète à des tarifs très compétitifs, ce qui en fait un logiciel de comptabilité adapté à la très grande majorité de nos lecteurs, quel que soit votre statut. Il propose pour les auto-entrepreneurs une offre facturation et comptabilité à partir de 11,67€ par mois.

Un grand éventail de fonctionnalités nécessaires à la tenue comptable d’une activité libérale ou d’une société est présent, dont la télétransmission de la liasse fiscale. On apprécie aussi l’assistance gratuite avec un support client disponible et réactif, qui rend le logiciel accessible même par les auto-entrepreneurs les plus novices.

Quelques modules mériteraient leur place dans ce logiciel comme la gestion des notes de frais, de la paie ou même du stock, tout comme une version mobile pour accéder au logiciel depuis n’importe où. Par contre, la présence d’un module de paie fait sortir du lot MaCompta, puisque peu de logiciels sur le marché permettent de faire facturation, comptabilité ET paie.

10. Tiime

Tiime est un logiciel de gestion qui inclut un module de facturation 100% gratuit.

Tiime est une offre complète pour créer des devis et factures personnalisés, gérer vos achats et dépenses et documents comptables. Il propose même un compte bancaire professionnel. Les encaissements sont accélérés grâce aux liens de paiement ou aux prélèvements. L’interface est ergonomique et très facile à utiliser.

Accessible à tous les statuts, il pourra vous suivre dans la croissance de votre auto-entreprise. L’offre est composée d’une formule gratuite dédiée à la facturation puis de deux formules payantes plus complètes.

11. Freebe

Freebe est un logiciel de devis et facturation pour indépendant, particulièrement adapté aux freelances en quête d’une solution de gestion abordable et efficace.

Outre la création de devis et de factures, il permet aussi de créer un livre de recettes et de dépenses, d’automatiser les déclarations auprès de l’URSSAF, …. En plus, les auto-entrepreneurs peuvent synchroniser l’outil avec leur banque pour une gestion facilitée.

Nous avons aussi apprécié d’autres fonctionnalités pensées pour les freelances, comme l’outil de time-tracking, pratique pour les ceux qui facturent au jour ou à l’heure, le tout pour un tarif abordable.

Les avantages d’un logiciel pour gérer sa facturation en auto-entrepreneur

Le gain de temps 

Pour les auto-entrepreneurs, la facturation est une mission additionnelle dont ils se passeraient bien. Alors pour se concentrer sur leur cœur d’activité et moins sur les tâches administratives, mieux vaut les automatiser. C’est justement pour cette raison que les logiciels de facturation comme Freebe ou Abby sont si prisés des freelances. Ils permettent, en effet, de gagner un temps précieux sur toutes les tâches d’édition de facturation, de gestion des comptes, de déclaration URSSAF, etc. 

L’accessibilité

Grâce à un logiciel de facturation, l’auto-entrepreneur peut éditer ses factures n’importe où : dans son bureau à l’aide de son ordinateur ou chez le client avec une tablette ou un smartphone. En effet, la plupart des logiciels sont accessibles depuis une multitude de dispositifs.  Par ailleurs, vous pouvez choisir entre les outils à télécharger et ceux disponibles en ligne. 

Le respect des obligations légales

Comme vu précédemment, la facturation des auto-entrepreneurs est soumise à un formalisme assez élevé (notamment du fait de toutes les mentions obligatoires exigées et de la numérotation). Alors pour éviter toute erreur ou tout oubli, utilisez un logiciel de facturation.  En plus de l’erreur humaine, ces outils pallient le manque d’information puisqu’ils se mettent à jour automatiquement en fonction des nouvelles lois en vigueur. Ainsi, vos factures sont toujours conformes.  

Les autres fonctionnalités

Outre la facturation, nombre des logiciels présentés vous proposent des fonctionnalités pour simplifier la gestion de votre activité au quotidien. Que ce soit pour la relation client, la comptabilité, les stocks, les relations fournisseurs, chaque fonction vous permet de vous consacrer à l’essentiel : votre business. 

Les critères de choix d’un logiciel de facturation freelance

Les fonctionnalités

C’est l’un des premiers critères pour choisir son logiciel de facturation auto-entrepreneur. Vous devez alors vous poser une question : souhaitez-vous un simple logiciel de facturation ou un outil de gestion ?

Si l’objectif est de minimiser le temps passé sur les tâches administratives, choisissez le logiciel le plus complet possible. Sélectionnez des fonctionnalités, telles que la gestion client, la déclaration URSAFF automatisée, la synchronisation bancaire…

Le rapport qualité prix

Le budget est souvent considéré comme le critère de choix principal d’un logiciel de facturation ou non d’ailleurs pour beaucoup d’entre vous. Ceci dit, nous pensons sincèrement que la question du budget doit être abordée sur un angle plus large que simplement avec l’objectif de chercher un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur pas cher, voire gratuit. L’équation n’est pas si simple, entre le prix du logiciel et le temps passé à l’utiliser.

Logiciel	Tarif mensuel HT, à partir de	Essai gratuit	Réduction
Abby	0€	Offre 100% gratuite	18% de réduction en cas de paiement annuel
Freebe	12,50 €	30 jours	36% de réduction en cas de paiement annuel
Tolteck	25 €	30 jours	24% de réduction en cas de paiement annuel
Obat	29 €	14 jours	22% de réduction en cas de paiement annuel
Indy	20 €	Offre 100% gratuite	Création d’entreprise offerte pour les nouveaux clients
Evoliz	15 €	15 jours	10% de réduction en cas de paiement annuel
Axonaut	41,99€	15 jours	20% de réduction en cas de paiement annuel
MaCompta	11,67 €	30 jours	17% de réduction en cas de paiement annuel

La question à vous poser est plutôt de savoir combien vaut votre temps de freelance, de profession libérale, d’artisan… Si vous prenez un logiciel de facturation gratuit, mais que vous devez y passer 2 jours par mois, combien seriez-vous prêt à payer pour n’y passer que 2 heures par mois ? Et la question reste la même si vous hésitez entre un logiciel à 30 € par mois et un logiciel à 10 € par mois.

Tenez en compte lorsqu’il s’agit d’utiliser notre comparatif des logiciels de facturation pour auto-entrepreneur, et ne comparez pas que le prix :

• les logiciels de facturation gratuits ne sont pas forcément les solutions les plus pérennes (mises à jour, ).
• ces logiciels ne sont pas toujours 100% gratuits (et souvent limités)
• est-ce qu’un logiciel gratuit est capable de vous accompagner dans votre croissance ?
• les logiciels payants sont souvent plus avancés techniquement, et font gagner davantage de temps sur la gestion.

Les évolutions possibles

Si vous êtes auto-entrepreneur, vous savez sans doute qu’il existe plusieurs seuils ; un pour le passage en TVA et l’autre pour le statut. Ainsi, si vous dépassez les 72 600 € de chiffre d’affaires annuel, vous n’aurez d’autres choix que de changer de statut juridique. Or, tous les logiciels ne s’adaptent pas d’un statut à l’autre.

Vous devez donc réfléchir à l’avenir de votre entreprise. Pensez-vous rester en dessous de ce seuil pour l’année à venir ou au contraire le dépasser ? Si vous n’y réfléchissez pas en amont, vous devrez sans doute changer de logiciel. Pour le coup, c’est une perte de temps qui peut facilement être évitée, et dans ce cas là nous vous conseillons d’opter plus un logiciel de facturation évolutif, comme Evoliz par exemple.

Les modalités d’usage

Logiciel à télécharger, disponible en ligne, sur PC, Mac, tablette, ou smartphone. Ce sont autant de possibilités proposées par les logiciels de facturation. Alors si vous êtes un auto-entrepreneur nomade, choisissez un logiciel à utiliser partout. 

FAQ