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De plus en plus de professionnels libéraux décident de gérer eux-mêmes leur comptabilité. Économies d’argent, autonomie, gain de temps, maîtrise des finances de son activité, les avantages sont nombreux. Que vous n’y connaissiez rien en comptabilité ou que vous soyez à l’aise avec ces tâches, les logiciels de comptabilité sont d’excellents outils qui vous simplifient le quotidien. 

Dans cet article, nous avons sélectionné pour vous les meilleurs logiciels de comptabilité adaptés aux professions libérales. Vous y trouverez aussi nos conseils pour choisir l’outil qui répondra le mieux à vos besoins.

  • Indy – Le meilleur pour l’interface ergonomique
  • Abby – Le meilleur pour son tarif compétitif
  • Evoliz – Le meilleur pour traiter les grands volumes de transactions
  • Macompta.fr – Le meilleur pour son accessibilité même pour les débutants
  • Freebe – Le meilleur pour son application mobile performante

Notre sélection des meilleurs logiciels de comptabilité pour professions libérales

Indy

Indy est LE logiciel de comptabilité dédié aux professionnels libéraux, tout statut (BNC et sociétés à l’IS) accepté.

indy-logo
Essai gratuit
  • 15 jours
  • Sans CB
  • Sans engagement
Avantages
  • Nombreuses automatisations
  • Interface simple et intuitive
  • Support client gratuit
Limites
  • Support uniquement par mail dans la version gratuite

Avec deux offres tarifaires transparentes et abordables, le logiciel de comptabilité en ligne Indy offre l’accès à de nombreuses fonctionnalités parfaitement adaptées aux besoins des activités libérales.

tableau de bord Georges

De la tenue comptable à l’édition de la liasse fiscale et la télétransmission, tout est disponible sur une plateforme ergonomique, simple et intuitive. Indy propose même un module de facturation illimité et gratuit.

Abby

Plus récemment arrivé sur le marché des logiciels de comptabilité pour les professions libérales en auto-entreprise, Abby a de nombreux arguments pour plaire.

abby-logo
Compte gratuit
  • Sans limite de durée
Avantages
  • Offre gratuite
  • Outil de gestion complet
  • Synchronisation bancaire
Limites
  • Auto-entrepreneur uniquement

La création d’un compte est 100% gratuite sans limite de durée, et permet déjà de gérer la facturation et la comptabilité d’une micro-entreprise : devis et facturation, synchronisation bancaire, gestion des tâches, déclarations URSSAF en 1 clic.

Abby tableau de bord

Abby est donc un logiciel de gestion tout-en-un pour les auto-entrepreneurs. Il rassemble toutes les fonctionnalités nécessaires à la gestion administrative et au pilotage de votre activité. De la facturation aux déclarations obligatoires en passant par la gestion de votre portefeuille de clients, rien n’est oublié.

Evoliz

Evoliz est un logiciel français de facturation et de comptabilité qui convient à toutes les professions libérales.

10€ de réduction
  • Sur la souscription annuelle
  • Essai 15 jours
Avantages
  • Outil de gestion et de pilotage de l’activité
  • Accepte tous les statuts
  • Aide à la configuration
Limites
  • Pré-comptabilité uniquement

Evoliz est avant tout un logiciel de facturation mais il possède toutes les fonctionnalités nécessaires pour la tenue comptable d’une micro-entreprise. On retrouve la synchronisation bancaire, le suivi de la trésorerie ou encore l’export-comptable.

Evoliz tableau de bord

Vous pourrez aussi gérer toute votre facturation avec un suivi avancé des factures. Performant et très complet, Evoliz vous fait gagner du temps une fois pris en main.

Freebe

Les indépendants, et particulièrement les freelances seront comblés avec notre prochain logiciel de comptabilité pour profession libérale. Freebe est en effet un outil complet qui regroupe la comptabilité et la facturation.

Logo Freebe
60 jours offerts
  • Avec le code INDE60
Avantages
  • Outil unique pour toute la gestion administrative
  • Déclaration URSSAF
  • Sans engagement
Limites
  • Personnalisation limitée des factures

Même si la comptabilité d’une profession libérale reste relativement simplifiée, les fonctionnalités contenues dans Freebe sont un réel atout. La comptabilité est automatisée, un module de gestion du temps permet de garder un œil sur sa productivité, les déclarations URSSAF peuvent être faites directement depuis le logiciel, et bien sûr le module de facturation est inclus. Pas mal de temps gagné donc !

Freebe déclaration URSSAF

On regrette qu’il n’existe pas de version mobile. L’outil est accessible à toutes les professions libérales sous un statut unipersonnel (micro-entrepreneur, SASU/SAS, EURL/SARL). Pour en savoir plus, lire notre avis sur Freebe.

Macompta.fr

Le logiciel en ligne Macompta.fr propose une offre complète à des tarifs très compétitifs, ce qui en fait un logiciel de comptabilité adapté aux professions libérales.

macompta logo
Essai gratuit
  • Pendant 30 jours
Avantages
  • Outil très accessible
  • Assistance technique par téléphone incluse
  • Application mobile
Limites
  • Pas de gestion des stocks

Un grand éventail de fonctionnalités nécessaires à la tenue comptable d’une activité libérale est présent. On apprécie aussi l’assistance gratuite avec un support client disponible et réactif, qui rend le logiciel accessible même par les plus novices.

macompta accueil

Quelques modules mériteraient leur place dans ce logiciel comme la gestion des notes de frais, de la paie ou même du stock, tout comme une version mobile pour accéder au logiciel depuis n’importe où.

Il existe de nombreux autres logiciels de comptabilité en ligne, spécifiques aux professions libérales ou non. Gest4u, Albus ou encore RDLibéral sont quelques autres solutions qui ont bonne réputation mais que nous n’avons pas encore eu l’occasion de tester.

Tableau comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité pour professionnel libéral

Vous l’aurez compris, le choix parmi les logiciels de comptabilité pour les professions libérales est vaste ! Alors pour vous aider à y voir plus clair, voici un tableau comparatif des offres de chacune des solutions sélectionnées.

LogicielsTarif (à partir de)Essai gratuitOffre
Indy0€60 jours30 jours offerts
Abby0€14 joursformule gratuite
Evoliz12,60€30 jours10% de réduction
sur l’abonnement annuel
macompta.fr13,25€15 joursEssai gratuit
Freebe12,50€60 jours
60 jours offerts
Tableau comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité pour professionnel libéral

Comment bien choisir son logiciel de comptabilité pour les professions libérales ? 

Plusieurs facteurs auront une influence sur le choix de votre logiciel de comptabilité pour professions libérales. Il n’existe pas de logiciel parfait, mais ces quelques conseils sur les critères de choix devraient pouvoir vous aider à faire votre sélection. 

Votre statut juridique

Une activité libérale peut être exercée sous différents statuts, en fonction de la profession exercée : micro-entrepreneur, entrepreneur individuel ou société. 

Pour rappel, le statut juridique d’une profession libérale dépend notamment si vous exercez une activité réglementée ou non.

Médecin, expert-comptable, avocat, architecte sont des professions libérales réglementées et sont sous le contrôle d’un ordre ou d’une chambre. Dans le cas de ces professions, certains statuts juridiques ne sont pas autorisés, notamment la micro-entreprise.  Les autres métiers définis comme profession libérale, c’est-à-dire définie par l’administration comme une activité intellectuelle, une science ou un art exercé comme activité principale, ont plus de liberté dans le choix de leur statut juridique. 

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Notre conseil Concernant le choix de votre logiciel de comptabilité, il faudra donc s’assurer que votre statut juridique est accepté et que les fonctionnalités du logiciel sont adaptées.

Nous l’avons vu, certains ne s’adressent qu’à un type de statut. C’est le cas de Abby ou Freebe pour les auto-entrepreneurs par exemple. À l’inverse, Indy s’adresse depuis peu à tous les statuts juridiques des professions libérales.

Le statut est assez important, car il a un impact sur la comptabilité des professions libérales. Elle est évidemment plus complexe en société qu’en auto-entreprise.

Les fonctionnalités

Les fonctionnalités proposées par le logiciel sont le second critère à prendre en considération lors de votre choix d’un logiciel de comptabilité. 

Il faudra au préalable définir précisément vos besoins, à interpréter aussi en fonction de votre statut juridique et de vos connaissances en comptabilité. Voici quelques fonctionnalités qui pourront être recherchées: 

  • Synchronisation bancaire ;
  • Reconnaissance visuelle des factures ou notes de frais ;
  • Télédéclaration/la télétransmission ;
  • Gestion de la TVA ;
  • Comptes annuels de fin d’année (bilan, compte de résultat, liasse fiscale, balances, déclarations…) ;
  • Version mobile ou non ;
  • Exports/imports.

D’autres fonctionnalités, au-delà de la comptabilité, sont parfois incluses et peuvent vous permettre de n’avoir qu’un seul et unique logiciel à utiliser. On pense par exemple à :

  • la facturation ;
  • la gestion de la paie (si vous employez des salariés) ;
  • la gestion du stock ;
  • la relation client.

Dernier point, l’ergonomie du logiciel rendra l’utilisation plus agréable et plus facile à prendre en main. Certains logiciels proposent un essai gratuit de 30 jours, le meilleur moyen de savoir si l’outil vous convient. 

Le budget/le temps à y consacrer

Si vous décidez de faire votre comptabilité seul, c’est certainement parce que vous souhaitez faire des économies de temps et d’argent. Se pose donc la question du budget que vous voulez/pouvez y consacrer. 

En tant que professionnel libéral, vous êtes de manière générale rémunéré sur la base du temps de travail effectif. Même si les logiciels gratuits sont attrayants, il est certain qu’ils sont rarement aussi performants que les logiciels payants. Il s’agit donc de comparer le bénéfice en termes de temps gagné entre un logiciel gratuit, un logiciel payant voire même pas de logiciel du tout.

Pour cela, nous vous proposons un calcul simple et qui pourra vous servir pour déterminer la rentabilité des outils payants que vous utilisez pour vos tâches administratives.  Ce calcul est le suivant :

  • Calculez votre chiffre d’affaires (mensuel par exemple) ;
  • Divisez le par le nombre de jour, puis d’heures travaillées ;
  • Vous obtenez donc un taux horaire ;
  • Comparez maintenant le coût, c’est-à-dire le nombre d’heures que vous consacriez à votre gestion comptable (y compris le temps passé à rectifier les erreurs…) ou le tarif d’un expert-comptable, avec le coût d’un logiciel de comptabilité ;
  • Vous obtenez le gain (ou la perte) entre les différentes options de gestion comptable qui s’offrent à vous.
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Notre conseil Les formules sans engagement de certains de ces logiciels seront un bon moyen pour estimer le temps nécessaire pour votre gestion comptable avec un outil adapté, en l’essayant directement.

Bien évidemment, ces logiciels requièrent aussi du temps de votre part, à prendre en compte dans votre calcul.

L’accessibilité

Dernier critère de sélection, il s’agit de l’accessibilité du logiciel. Comme vous avez pu le voir, vous pouvez choisir entre des logiciels 100% en ligne ou des logiciels à télécharger. Les logiciels en ligne offrent de nombreux avantages, et représentent selon nous la meilleure solution en 2025 :

  • accès depuis n’importe où (avec une connexion internet), voire depuis n’importe quel support (pour ceux avec une version mobile) ;
  • mises à jour automatiques et gratuites ;
  • accès partagé avec son expert-comptable le cas échéant ;
  • des tarifs attractifs ;
  • des outils modernes, ergonomiques, intuitifs.

Si ces facteurs n’ont pas d’impact sur votre gestion comptable, alors un logiciel à télécharger pourra aussi vous convenir, tout est une question d’habitude, et de préférence.

Dans ce cas, privilégiez le même outil que celui de votre expert-comptable, si vous faites appel à ce type de professionnel. De plus, souvenez-vous que les logiciels à télécharger :

  • signifient l’achat d’une licence ;
  • ne bénéficient pas des mises à jour ;
  • sont accessibles uniquement sur le pc sur lequel ils sont installés.

Quelles alternatives aux logiciels de comptabilité ? 

Même si les logiciels de comptabilité attirent de plus en plus de professionnels, il existe toujours d’autres solutions, que voici.

Faire appel à un expert-comptable

Il est possible de confier tout ou partie de sa gestion comptable à un expert-comptable. Vous pourrez d’ailleurs choisir entre des experts-comptables “classiques” et experts-comptables en ligne.

La première option est particulièrement répandue chez les professionnels libéraux qui souhaitent s’alléger de la charge de travail liée à la comptabilité. Mais l’offre innovante des experts-comptables en ligne mérite de s’y intéresser, car elle est adaptée à de nombreuses professions libérales.

Parmi les experts-comptables en ligne, Keobiz ou encore Dougs (qui propose un vrai logiciel de comptabilité pour les professions libérales) sont deux options intéressantes.

Faire sa comptabilité seul

Dernière option qui s’offre à vous, vous pouvez réaliser votre comptabilité tout seul sans logiciel de comptabilité pour profession libérale.

Certains utilisent Excel. Sachez cependant que cette méthode n’est pas recommandée car elle ne respecte pas certaines obligations liées à la gestion comptable, et notamment l’interdiction de modifier ou supprimer des données.  Par contre, il est tout à fait possible de tenir sa comptabilité à la main.

FAQ

L’utilisation d’un logiciel de comptabilité est-elle obligatoire pour les professions libérales ?

Les professions libérales, comme les autres entrepreneurs d’ailleurs, n’ont aucune obligation de recourir à un logiciel de comptabilité. Comme nous l’avons vu, il est possible de tenir sa comptabilité manuellement, simplement avec un papier et un crayon. L’utilisation d’un tableur est par contre à éviter.

Peut-on faire l’intégralité de sa gestion comptable soi-même ?

Les obligations comptables des professions libérales sont variées et dépendent principalement du statut juridique. Avec une comptabilité simplifiée, les auto-entrepreneurs ont clairement la possibilité de faire l’ensemble de leur gestion comptable seul. Pour les autres statuts, cela va dépendre de vos connaissances, de votre appétence et du temps que vous pouvez y consacrer. C’est donc à vous de voir, en fonction de vos capacités et de vos compétences, si vous souhaitez mener cette tâche intégralement. Il est aussi possible de confier une partie de sa comptabilité à un expert-comptable en ligne ou non, telle que l’édition des comptes annuels par exemple.


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Guillaume Robez Responsable éditorial

Guillaume est le cofondateur d'independant.io. Diplômé d'HEC en marketing digital, il a passé 7 ans chez Google en tant qu'analyste dans les équipes dédiées aux clients du secteur de la finance.

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