Vous êtes nombreux à choisir un logiciel de comptabilité pour votre micro-entreprise, tant pour gagner du temps que pour limiter les erreurs (et ce même si les obligations comptables en micro restent limitées).

Pour vous aider à choisir votre outil, voici notre sélection des meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs en 2023. Vous pourrez aussi vous appuyer sur nos critères de sélection fournis en deuxième partie pour faire le bon choix.

Pour vous aider à faire le bon choix, nous avons donc sélectionné plusieurs logiciels qui correspondent à la très grande majorité des besoins :

Vous remarquerez que notre sélection contient uniquement des logiciels dits SaaS, utilisables directement en ligne. Plus modernes, avec un rapport qualité/prix plus intéressant et adaptés aux professionnels en mouvement, ils conviennent davantage à votre statut selon nous. Nous avons donc concentré notre sélection sur ce type de logiciel pour auto-entrepreneur.

Notre sélection des meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs

1. Indy

Indy est un logiciel de comptabilité moderne et intuitif, au tarif fixe et transparent. Il s’adresse aux professions libérales qui souhaitent prendre en main leur gestion comptable (BNC et sociétés à l’IS acceptés).

indy-logo
Essai gratuit
  • 15 jours
  • Sans CB
  • Sans engagement
Avantages
  • Adapté aux indépendants avec une activité libérale ou de service, tous statuts adaptés
  • Synchronisation bancaire et catégorisation comptable
Limites
  • Pas de module facturation

Avec deux offres tarifaires transparentes et abordables, le logiciel de comptabilité en ligne Indy offre l’accès à de nombreuses fonctionnalités parfaitement adaptées aux besoins des activités libérales.

tableau de bord Georges

De la tenue comptable à l’édition de la liasse fiscale et la télétransmission, tout est disponible sur une plateforme ergonomique, simple et intuitive. Seul bémol, il faudra vous équiper d’un autre outil pour la facturation puisqu’Indy ne dispose pas de module de facturation pour le moment. À noter qu’Indy propose la création d’entreprise gratuitement pour ceux qui sont en train de se lancer.

2. Abby

Plus récemment arrivé sur le marché des logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs, Abby a de nombreux arguments pour plaire.

abby-logo
Compte gratuit
  • Sans limite de durée
Avantages
  • Adapté aux indépendants avec une activité libérale ou de service, tous statuts adaptés
  • Synchronisation bancaire
  • Tarifs compétitifs
Limites
  • Application mobile

La création d’un compte est 100% gratuite sans limite de durée, et permet déjà de gérer la facturation et la comptabilité d’une micro-entreprise (devis et facturation, synchronisation bancaire, gestion des tâches , déclarations URSSAF…).

Abby tableau de bord

Abby est donc un logiciel de gestion tout-en-un pour les auto-entrepreneurs. Il rassemble toutes les fonctionnalités nécessaires à la gestion administrative et au pilotage de votre activité. De la facturation aux déclarations obligatoires en passant par la gestion de votre portefeuille de clients, rien n’est oublié.

3. Evoliz

Logiciel 100% français, Evoliz vous permet de gérer votre facturation et de piloter votre activité grâce à de nombreux outils de gestion et de comptabilité.

Evoliz logo
– 10% de réduction
  • Sur la souscription annuelle
  • Essai 30 jours
Avantages
  • Nombreuses automatisations
  • Paiement en ligne des factures
  • Essai gratuit
Limites
  • Prise en main un peu complexe

Evoliz est un logiciel de facturation performant et très complet. La création d’un devis ou d’une facture se fait en quelques clics grâce aux nombreuses automatisations. On apprécie les fonctions de suivi des factures (visualisation par les clients, relances, …) et la possibilité de payer en ligne. Mais Evoliz va plus loin puisqu’il est aussi doté de fonctionnalités pour la pré-comptabilité, la gestion de la relation client, du stock et des fournisseurs.

Evoliz tableau de bord

Du fait de la richesse des fonctionnalités, Evoliz requiert un peu de temps pour le configurer et le prendre en main. Mais une fois cette phase achevée, il fait incontestablement gagner du temps à tous ses utilisateurs. Vous choisissez entre trois formules tarifaires et bénéficiez d’un accompagnement individuel pour installer l’outil.

4. Freebe

Freebe est un logiciel de devis et facturation pour auto-entrepreneur, particulièrement adapté aux freelances en quête d’une solution de gestion abordable et efficace.

Logo Freebe
Essai gratuit
  • 60 jours offerts code INDE60
Avantages
  • Comptabilité automatisée
  • Déclaration URSSAF
  • Démo privée sur demande
Limites
  • Auto-entrepreneur uniquement

Outre la création de devis et de factures, il permet aussi de créer un livre de recettes et de dépenses, d’automatiser les déclarations auprès de l’URSSAF, …. En plus, les auto-entrepreneurs peuvent synchroniser l’outil avec leur banque pour une gestion facilitée.

Freebe déclaration URSSAF

Nous avons aussi apprécié d’autres fonctionnalités pensées pour les freelances, comme l’outil de time-tracking, pratique pour les ceux qui facturent au jour ou à l’heure, le tout pour un tarif abordable.

5. MaCompta.fr

Le logiciel en ligne Macompta.fr propose une offre complète à des tarifs très compétitifs, ce qui en fait un logiciel de comptabilité adapté à la très grande majorité de nos lecteurs, quel que soit votre statut.

macompta logo
Essai gratuit
  • Pendant 30 jours
Avantages
  • 100% en ligne, complet et accessible
  • Synchronisation bancaire
  • Accepte tous les statuts
Limites
  • Pas de gestion des stocks

Un grand éventail de fonctionnalités nécessaires à la tenue comptable d’une activité libérale ou d’une société est présent, dont la télétransmission de la liasse fiscale. On apprécie aussi l’assistance gratuite avec un support client disponible et réactif, qui rend le logiciel accessible même par les auto-entrepreneurs les plus novices.

macompta accueil

Quelques modules mériteraient leur place dans ce logiciel comme la gestion des notes de frais, de la paie ou même du stock, tout comme une version mobile pour accéder au logiciel depuis n’importe où. Par contre, la présence d’un module de paie fait sortir du lot MaCompta, puisque peu de logiciels sur le marché permettent de faire facturation, comptabilité ET paie.

Les avantages d’un logiciel de comptabilité

Voici les 4 principaux avantages à utiliser un logiciel pour faire votre comptabilité :

  1. Efficacité et gain de temps : l’automatisation des tâches de saisie comptable et de récolte des justificatifs, mais aussi la gestion de la TVA ou encore des factures vous fera gagner beaucoup de temps, à vous et à votre expert-comptable.
  2. Collaboration : que votre comptabilité soit internalisée ou externalisée, les logiciels de comptabilité vous permettent de centraliser les données. La répartition des tâches et la collaboration en sont ainsi facilitées.
  3. Moins de risques d’erreurs : l’utilisation d’un logiciel diminue fortement le risque d’erreurs (doublons, mauvaises saisies…) et de pertes de données et vous permet d’être en conformité avec la réglementation en vigueur.
  4. Pilotage de votre activité : les outils de suivi et les systèmes de relances et d’alertes vous permettent de mieux piloter votre activité en temps réel, et sont ainsi un précieux allié dans la gestion quotidienne de votre activité.

Comment choisir un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur ?

Notre sélection des meilleurs logiciels pour auto-entrepreneurs est fondée sur des critères qui nous paraissent importants au vu des spécificités de votre statut. Bien évidemment, il s’agira de choisir surtout un logiciel qui conviendra le mieux à votre situation, votre activité, vos préférences. Pour vous aider à faire votre choix, voici les critères à prendre en considération avant de prendre votre décision.

Un logiciel dédié ou non ?

Certains logiciels sont entièrement et uniquement dédiés aux micro-entreprises, alors que d’autres sont ouverts à d’autres statuts. Les premiers, tels que Freebe, auront donc des fonctionnalités plus restreintes et limitées uniquement à ce dont vous aurez besoin. Pour les autres, il faudra identifier au préalable les fonctions dont vous vous servirez et ignorez les autres. 

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Les logiciels dédiés ont pour avantage une prise en main plus rapide et sont plus précis dans la gestion de votre micro-entreprise. Il s’adaptent par exemple aux changements de seuils de TVA.

Par contre, si votre entreprise évolue et change de statut pour devenir une société, il faudra alors changer de logiciel (avec le risque de perdre l’historique de votre comptabilité). Des logiciels non dédiés comme Sinao pourront être conservés si vous changez de statut juridique (passer d’auto-entrepreneur à SASU par exemple).

Type de logiciel

Même si nous avons une forte préférence pour les logiciels de comptabilité en ligne, nous savons quand même que ce n’est pas le cas de tous les entrepreneurs. Bien choisir son logiciel comptable, c’est aussi choisir un logiciel qu’on ne rechignera pas à utiliser, à vous de voir selon vos préférences :

  • En ligne ou à télécharger (+ Mac ou Windows)
  • Mobile ou non

Nous avons une préférence affichée pour les logiciels de comptabilité en ligne, souvent plus simples, mis à jour automatiquement et utilisable de partout. Sachez quand même que les logiciels à télécharger peuvent vous convenir, d’autant plus que certains possèdent une profondeur fonctionnelle très importante (car historique).

Si vous optez pour une solution à télécharger, renseignez-vous bien, car les logiciels de comptabilité sur Mac se font rares, et trouvez une solution pérenne pour vos sauvegardes. Concernant le mobile, c’est un peu lié, mais si vous aimez éditer vos devis et factures voire gérer votre comptabilité sur mobile, ce sera impossible avec un logiciel à télécharger.

Les fonctionnalités

Les fonctionnalités du logiciel sont un critère primordial. Il faudra les comparer avec vos besoins et décider si toutes les fonctionnalités présentes remplissent vos attentes envers ce logiciel. 

Pour les micro-entrepreneurs, certaines fonctionnalités sont indispensables comme la tenue du registre des recettes et des dépenses. D’autres offrent de réels avantages telles que la télédéclaration à l’URSSAF, la synchronisation bancaire, une application mobile dédiée, et l’intégration de fonctions de facturation.

Enfin, certains métiers imposent des besoins différents, comme par exemple les artisans. Ceux-ci préfèrent alors parfois cumuler deux outils. un logiciel devis-facture bâtiment, et un logiciel de gestion / comptabilité plus complet. À vous donc de lister vos besoins et de trouver le logiciel qui y répondra au mieux. 

Ergonomie et simplicité

Vous êtes aussi nombreux à chercher un logiciel de comptabilité simple. Encore une fois, testez donc les solutions proposées, pour voir si l’ergonomie est au rendez-vous, et surtout si vous arrivez à vous servir du logiciel sans avoir besoin de support ou formation (qui peuvent avoir un coût chez certains éditeurs).

Rapport qualité-prix

Le budget est souvent considéré comme le critère de choix principal d’un logiciel (de comptabilité ou non d’ailleurs) pour beaucoup d’entre vous. Ceci dit, nous pensons sincèrement que la question du budget doit être abordée sur un angle plus large que simplement avec l’objectif de chercher un logiciel de comptabilité pas cher, voire gratuit. L’équation n’est pas si simple, entre le prix du logiciel et le temps passé à l’utiliser.

LogicielTarif mensuel
HT, à partir de
Essai gratuitRéduction
Abby0 €14 jours18% de réduction
en cas de paiement annuel
Indy20 €15 joursCréation d’entreprise offerte
pour les nouveaux clients
Evoliz15 €30 jours17% de réduction
en cas de paiement annuel
MaCompta17 €30 jours17% de réduction
en cas de paiement annuel
Freebe11 €30 jours36% de réduction
en cas de paiement annuel

La question à vous poser est plutôt de savoir combien vaut votre temps d’entrepreneur, de freelance, de profession libérale… Si vous prenez un logiciel de comptabilité gratuit, mais que vous devez y passer 2 jours par mois, combien seriez-vous prêt à payer pour n’y passer que 2 heures par mois ? Et la question reste la même si vous hésitez entre un logiciel à 30 € par mois et un logiciel à 10 € par mois.

Tenez en compte lorsqu’il s’agit d’utiliser notre comparatif des logiciels de comptabilité, et ne comparez pas que le prix :

  • les logiciels de comptabilité gratuits ne sont pas forcément les solutions les plus pérennes (mises à jour, ).
  • ces logiciels ne sont pas toujours 100% gratuits (et souvent limités)
  • est-ce qu’un logiciel gratuit est capable de vous accompagner dans votre croissance ?
  • les logiciels payants sont souvent plus avancés techniquement, et font gagner davantage de temps sur votre comptabilité.

Combien coûte un logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur ?

Passons sur la question des logiciels de comptabilité gratuits, qui sont souvent limités et font en général gagner moins de temps que des logiciels payants. Nous en avons déjà suffisamment parlé plus haut. Il n’y d’ailleurs dans notre sélection qu’Abby qui est gratuit dans la version comptabilité.

Les tarifs relevés dans notre comparatif des logiciels de comptabilité varient. En moyenne, comptez une dizaine d’euros par mois pour en profiter, à l’image de ce que propose Evoliz dans leur offre d’entrée de gamme. Ce montant augmente en fonction des options que vous allez choisir. En règle générale, les solutions de comptabilité proposent plusieurs offres évolutives : plus vous choisirez de fonctionnalités, plus votre abonnement sera onéreux. Les prix peuvent alors grimper jusqu’à 30 à 50 euros par mois pour gérer à la fois la facturation, la comptabilité, ou encore la partie commerciale avec des acteurs comme Axonaut ou Sellsy.

Du côté des logiciels « on premise » ou à télécharger, vous achetez une licence, donc le tarif peut-être beaucoup plus élevé.

FAQ

Un logiciel de comptabilité est-il obligatoire ?

Rappelons que le logiciel comptable n’est pas obligatoire, mais il est fortement conseillé pour les entreprises, pour gagner du temps, éviter les erreurs et faciliter le dialogue avec l’administration. Seules les microentreprises pourront éventuellement s’en passer, mais sachant que de nombreux outils sont abordables pour ce statut, elles font aussi souvent le choix d’un logiciel. Certains sont tentés d’utiliser Excel, mais retenez qu’Excel ne permet pas de figer les mouvements comptables, et ne respecte donc pas la loi. L’administration fiscale déteste ce système, la fraude est facile, et les erreurs vous seront moins pardonnées. Si vous voulez-vous passer du logiciel, il faudra donc faire appel à un expert-comptable ou bien faire votre comptabilité à la main (et dans ce cas il ne nous reste plus qu’à vous souhaiter bon courage).

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité ?

Comme nous l’avons mentionné, il n’y a pas de meilleur logiciel pour tout le monde, il faudra au préalable étudier vos besoins. Ceci dit, les logiciels de comptabilité en ligne Abby et Indy sont souvent cités comme les plus adaptés pour la plupart de nos lecteurs.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité gratuit ?

Il n’existe pas de logiciel de comptabilité complet et gratuit. Odoo par exemple est un ERP dont le module comptabilité est gratuit (mais vous devrez payer pour ajouter des modules nécessaires à la gestion complète de votre entreprise).

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Guillaume Robez Responsable éditorial

Guillaume est le cofondateur d'independant.io. Diplômé d'HEC en marketing digital, il a passé 7 ans chez Google en tant qu'analyste dans les équipes dédiées aux clients du secteur de la finance.

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