Les 7 meilleurs logiciels RH & Paie en 2025

Établir une fiche de paie figure parmi les principales obligations de l’employeur. Il devra s’assurer que celle-ci est conforme à la loi et comporte l’ensemble des mentions obligatoires. Il peut ensuite procéder au paiement des déclarations sociales auprès de l’administration et verser la rémunération correspondante.

Dans une optique de simplification de la paie, il est désormais possible de réaliser une fiche de paie en ligne via l’un des nombreux logiciels du marché. Pour vous aider à y voir plus clair, voici un guide et une sélection logiciels de paie en ligne parmi les plus réputés du marché, et possédant des fonctionnalités RH :

• Payfit – Paie et RH pour les TPE-PME
• Factorial – Le meilleur pour centraliser la gestion des RH
• My Silae – Paie en ligne pour les TPE, PME et ETI avec possibilité d’externalisation
• Kelio – Paie en ligne pour les entreprises de 10 à 150 salariés
• Cegid Payroll Ultimate – Le meilleur pour les environnements complexes et multi-sites
• Skello – Le meilleur pour gérer des variables de paie complexes
• Malibou – Le meilleur pour accepter toutes les CCN

Notre sélection des meilleurs logiciels RH & Paie

Payfit

Adressée aux TPE et PME, Payfit est une solution RH Saas destinée principalement à la gestion de la paie mais avec d’autres fonctionnalités RH nécessaires à l’élaboration de celle-ci : congés payés, suivi des absences, notes de frais, etc.

Factorial

Particulièrement adapté pour la gestion RH des PME, Factorial propose un large éventail de fonctionnalités RH qui facilitent grandement la gestion de la paie. Ses nombreuses automatisations assurent la centralisation et la synchronisation des variables de paie entre les différents modules (administration RH, gestion des plannings, gestion des temps, recrutement, etc.) pour un transfert facilité vers votre prestataire paie. Les bulletins de paie sont ensuite accessibles par toutes les parties prenantes depuis l’interface.

My Silae

My Silae est un logiciel de gestion de paie en ligne créé en 2010 et se positionnant comme l’un des leaders des logiciels de paie et SIRH. Avec Silae, les automatisations poussées et les différents degrés d’autonomie permettent de recentrer le travail des collaborateurs sur des tâches à forte valeur ajoutée. On apprécie les fonctionnalités complémentaires, qui en font une solution SIRH paie complète et exhaustive pour traiter la paie et les tâches associées.

Kelio

Kelio (anciennement 123Paie by BodetSoftware) est un logiciel complet de gestion de la paie. Il s’adresse aux PME, tous secteurs d’activité confondus, mais c’est surtout pour les entreprisses de 10 à 150 salariés qu’il se distingue. Une fois le paramétrage effectué par Kelio, votre logiciel vous permet de traiter tout le processus de paie : collecte des éléments variables, édition des bulletins, déclarations sociales et traitement comptable.

Cegid Payroll Ultimate

Cegid Payroll Ultimate est une solution SaaS dédiée à la gestion de la paie et à l’administration du personnel proposée par le célèbre éditeur Cegid. Conçue pour automatiser les processus, elle optimise le traitement des salaires et la gestion des collaborateurs, garantissant à la fois gain de temps et fiabilité. Elle inclut la gestion automatisée de la paie et des déclarations sociales, mais aussi la gestion des congés et absences, un module d’épargne salariale et un reporting RH avancé. C’est une solution pensée pour les PME et ETI aux besoins avancés et ayant des exigences spécifiques en matière de conformité, d’automatisation et d’intégration avec leurs outils RH.

Skello

Si vous devez gérer des plannings parfois complexes, alors Skello est la solution idéale pour simplifier efficacement votre gestion des ressources humaines et de la paie. Skello est un logiciel particulièrement adapté aux entreprises du secteur de la restauration, du tourisme ou encore de la santé où la gestion des présences et des congés complexifie le traitement de la paie.

Malibou

malibou est un un SIRH paie en ligne complet et destiné aux TPE et PME dès 5 salariés. Son objectif ? Rendre simple des processus complexes, afin de permettre aux entreprises et à leurs équipes de se concentrer sur le cœur de leur activité. La plateforme permet de centraliser et assurer simplement la gestion de la paie et des ressources humaines au sein d’un outil unique tout en bénéficiant d’un accompagnement humain personnalisé par un expert en paie. Ce dernier produit, contrôle et réalise vos bulletins tout en répondant à vos questions par chat et téléphone. Autre avantage : toutes les conventions collectives sont acceptées.

Les logiciels mentionnés figurent parmi les plus connus du marché. Cependant, il existe d’autres logiciels de paie en ligne comme Silae, ADP et Cegid ou encore Openpaye qui sont des solutions intéressantes, avec un bon rapport qualité-prix.

Qu’est-ce qu’un logiciel RH pour la gestion de la paie ?

Un SIRH pour la gestion de paie se compose de divers modules permettant une élaboration fiable de la paie, depuis la récolte des éléments variables de paie à l’établissement du bulletin de paie en passant par la réalisation des diverses formalités déclaratives.

À quoi sert un SIRH paie ?

Le principal intérêt d’un logiciel RH pour la gestion de la paie paie consiste à automatiser un certain nombre de tâches nécessaires à la réalisation du bulletin de paie. En effet, dès l’entrée du salarié jusqu’à sa sortie des effectifs, la paie, mais aussi la gestion RH et comptable, s’en trouvent impactées.

Se doter d’un SIRH paie sert donc à centraliser et traiter toutes les informations relatives à la paie afin d’assurer gestion de la paie complète et fiable.

Quelles sont les fonctionnalités d’un SIRH pour la gestion de la paie ?

Un logiciel RH permettant d’établir les fiches de paie comprend l’ensemble des fonctionnalités destinées à la gestion de paie et à l’administration du personnel. L’entreprise peut s’appuyer sur une solution fiable et efficace pour produire ses bulletins de paie, réaliser les exports comptables et les déclarations sociales.

Les fonctionnalités d’un SIRH pour la gestion de la paie peuvent donc être distinguées entre :

• d’une part, la collecte de toutes les données, et notamment les éléments variables ;
• et d’autre part, l’établissement des bulletins de paie et la réalisation des obligations légales.

D’autres SIRH paie proposent une gestion à 360° de la paie et des RH. Cela signifie qu’ils facilitent la réalisation de la paie en faisant le pont entre les différentes phases du parcours collaborateur. C’est le cas notamment lors de :

• l’entrée du salarié, c’st-à-dire la phase d’onboarding ;
• la collecte des éléments variables de paie ;
• et lors de la sortie du salarié des effectifs de l’entreprise, appelée phase d’offboarding.

Pour faire simple, vous aurez le choix entre des logiciels de paie en ligne avec des fonctionnalités RH, permettant de gérer la paie de A à Z mais avec quelques limites sur les fonctionnalités RH, et des logiciels beaucoup plus avancés sur les fonctionnalités RH, mais dont certains ne permettent que la pré-paie. D’autres, comme Rippling, sont assez complets sur les deux.

Les 3 avantages d’un logiciel RH paie

Pourquoi opter pour un SIRH paie ? Ces outils présentent de nombreux avantages, quel que soit la taille de votre entreprise. Voici les principaux.

1. Fiabiliser la production de la paie face à une législation sociale complexe

La gestion des ressources humaines et la paie en particulier sont des activités particulièrement chronophages. Cela est dû en partie aux exigences légales et administratives qui nécessitent la mise en place d’une gestion pointilleuse et rigoureuse.

En parallèle, la multiplication des tâches et l’intervention de nombreux interlocuteurs tout au long du processus de paie rendent celle-ci particulièrement complexe. L’utilisation d’un SIRH paie permet de s’appuyer sur un outil expert et spécialisé pour faire de la gestion de paie un véritable vecteur de confiance pour l’ensemble de l’entreprise.

2. Gagner du temps grâce à l’automatisation du processus paie

L’automatisation des tâches récurrentes et la centralisation des données essentielles sont déterminantes pour toute organisation. La première vocation d’un logiciel SIRH pour la gestion de la paie est d’éliminer l’ensemble des micro-tâches qui font perdre du temps à l’équipe RH et empêche celle-ci de prendre de se concentrer sur des missions à plus forte valeur ajoutée.

3. Faciliter la gestion comptable

Dès lors que les effectifs de votre entreprise augmentent, votre gestion des chiffres et données comptables est essentielle. En effet, les données paies sont intégrées en comptabilité. Une erreur sur celles-ci entraîne des réactions en chaîne sur la gestion comptable. En outre, des erreurs en paie peuvent donner lieu à diverses amendes, redressement URSSAF, litiges, etc.

Comment choisir le meilleur SIRH paie ?

Afin de choisir le meilleur SIRH paie, voici les éléments essentiels sur lesquels vous devez vous pencher pour faire le choix le plus approprié.

Les fonctionnalités paie

Le premier point qui doit retenir votre attention est bien sûr les fonctionnalités paie de votre logiciel. En effet, en fonction de la croissance de votre entreprise et des compétences dont vous disposez en interne, vous aurez besoin de fonctionnalités paie plus ou moins élargies. Par exemple, demandez-vous si parmi les fonctionnalités paie, vous avez besoin que la DSN soit prise en charge par le logiciel, ou bien que la collecte des éléments variables de paie soit traités de façon automatisée.

Le type de logiciel

Il existe deux types de SIRH paie :

• le SIRH de paie spécialisé qui permet de gérer dans un seul et même outil la paie dans sa globalité, de l’entrée du salarié jusqu’à sa sortie des effectifs, et en toute autonomie ;
• le SIRH généraliste qui comprend plusieurs modules, dont des fonctionnalités de paie plus ou moins avancées.

Les premiers vous permettent de réaliser votre paie en toute autonomie, depuis un logiciel dédié, sans devoir faire appel à un expert-comptable ou un second logiciel pour établir les bulletins de paie.

Les SIRH généralistes ont pour avantage de centraliser toute votre gestion des RH, y compris la paie, depuis un unique outil. Certains, grâce à des fonctionnalités complètes de paie, se suffisent à eux-mêmes. D’autres doivent être couplés à un logiciel de paie ou conviennent si vous confier la finalisation de la paie à un cabinet d’expert-comptable.

Le choix dépend surtout de votre organisation actuelle, du volume de bulletins de paie à établir, des outils que vous utilisez actuellement ou à venir, etc.

Les autres fonctionnalités RH

Nous venons de le dire, certains SIRH paie tout-en-un proposent un ensemble de fonctionnalités RH complémentaires pour gérer d’autres problématiques RH telles que le recrutement, l’onboarding, les plannings, la gestion des congés et le suivi des absences.

Cette solution reste souvent très pratique mais nécessite de choisir un éditeur de logiciel réactif et fiable. Le cas échéant, vous risqueriez de prendre du retard sur vos paies ou bien de faire des erreurs sur celles-ci.

Le budget

La question du budget ne doit pas être prise à la légère. Nous vous recommandons d’éviter les solutions dites gratuites, car vous prendriez le risque de voir vos données perdues ou divulguées à des tiers.

Pour un pilotage optimal de votre entreprise, il est souvent préférable de penser votre gestion de la paie et des RH de façon globale en vous appuyant sur un véritable cahier des charges SIRH. Cela vous permettra d’avoir une vision d’ensemble de vos process, les optimisations possibles et le budget à allouer.

Opter pour la solution la moins chère est rarement judicieux. Nous vous conseillons plutôt de trouver le logiciel de paie qui répond le mieux à vos besoins, même s’il est un peu plus cher. À terme, votre investissement sera vite rentabilisé.

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